Para o desenvolvimento da pesquisa, os docentes e discentes contam com os seguintes laboratórios e um programa:
- LAGEL – Laboratório de Gestão Local e Meio Ambiente;
- LAEM – Laboratório de Estudos Municipais para o Ordenamento do Território;
- LEMAC – Laboratório de Educação, Meio Ambiente e Cultura;
- LARC – Laboratório de Representação Geográfica e Geoprocessamento;
- LAET – Laboratório de Etnofamácia;
- POEMA – Programa Pobreza e Meio Ambiente.
Os dois últimos possuem equipamentos específicos para o seu desenvolvimento. Os três primeiros laboratórios requerem apenas equipamentos de informática e geoprocessamento, sendo assim apoiados pelo laboratório institucional denominado LARC (Laboratório de Representação Geográfica e Geoprocessamento). Tanto os alunos de mestrado quanto os bolsistas de iniciação científica se utilizam dessa estrutura laboratorial.
O Programa POEMA dispõe de uma ampla infraestrutura física voltada para o aproveitamento dos recursos naturais, que é composta por um laboratório para produção de mudas, através do processo de micro-propagação (situados na Cidade Universitária). Até 2013 existiam sete unidades piloto de processamento de fibras e diversos experimentos de sistemas agro-florestais e agrossilvopastoris, no interior do Estado - nas regiões Marajó, Sudeste e Nordeste Paraenses. Em 2014 encerraram-se essas experiências. A partir de 2014 o Programa Pobreza e Meio Ambiente inicia uma reestruturação e a definição de novas áreas de pesquisa-ação que deverão expressar resultados a partir de 2015.
O LAET (Laboratório de Etnofamácia), localizado nas dependências do POEMA é fruto de projetos de aproveitamento de fitoterápicos, desenvolvidos com o apoio da Superintendência de Desenvolvimento da Amazônia (SUDAM) e do Fundo de Ciência e Tecnologia do Estado do Pará.
O Grupo de Pesquisa em Aproveitamento da Água da Chuva na Amazônia, Saneamento e Meio Ambiente (GPAC Amazônia), liderado pelo Prof. Ronaldo Mendes, que também envolve pesquisadores dos Institutos de Tecnologia (ITEC) e de Ciências da Educação (ICED) da UFPA, em especial de engenharia civil e engenharia ambiental e pedagogia, utiliza o laboratório do ITEC (4 salas) para realização de atividade que requerem análises técnicas. Em termos aplicados, entre outras atividades, o grupo tem desenvolvido projetos para usos de água da chuva para fins potáveis em edificações de populações rurais da Amazônia.
De fato, dependendo do tipo de suporte necessário para a realização dos trabalhos de dissertação, o PPGEDAM busca apoio em laboratórios de outros institutos da UFPA e de órgãos de pesquisa do Estado, em particular nas instituições nas quais os docentes do PPGEDAM têm vinculo ou relação de pesquisa, em particular UFPA, Museu Paraense Emílio Goeldi e EMBRAPA Amazônia Oriental.